平远县治始设于明朝嘉靖四十一年(1562)。当时以广东程乡县的豪居都(今仁居)为中心，并析福建的武平、上杭，江西的安远，广东惠州府的兴宁四县边地，以原设在豪居都林子管通判府馆址为基础，扩大筑城，罢馆置县。因其界于武平、安远之间，故名平远。初隶江西赣州府。明嘉靖四十三年 (1564)，调整县域，归还闽赣两省武平、上杭，安远三县原析之地，增析程乡的义化、长田、石窟三都及兴宁原析之大信一里，仍组成平远县，改隶广东潮州府，县治仍设在豪居都。明崇祯七年(1634)，析平远的石窟一图、二图，及程乡部分地域，增置镇平县(即今蕉岭)。清雍正十一年(1733)，程乡县升格为嘉应州，平远改隶嘉应州，与程乡、兴宁、长乐，镇平4县并称嘉应迸属。

民国成立后，废除原有建制，省县之间另设道。民国3年(1914)，设潮循道，平远为下属之一县。民国9年(1920)，裁道，平远直属于省。民国25年8月，两广还政中央，广东取消绥靖区，改设9个行政督察区，平远属第六区。民国38年(1949)，调整改属第九行政督察区。

1949年5月22日，平远宣告和平解放。1949年10月，中华人民共和国成立后，省县之间仍沿袭民国时期的专员公署制，作为省派出机构以领导县，平远隶属兴梅专员公署。1952年，兴梅专署撤销，改隶粤东行政公署。1956年,粤东行政公署撤销，分设惠阳、汕头两专区，平远隶属汕头专区。1965年，兴梅与潮汕分设专区，平远隶属梅县地区行政专员公署。1988年，梅县行署改为市一级政权机构，称梅州市，平远隶属梅州市。

1951年5月，大信乡划归兴宁县辖。1956年1月，梅县石扇乡黄竹坪村划入平远热柘乡。至此，县属地域均为原程乡县地。县治所在地，从1562年建县至1952年的390年，一直在仁居镇(明朝称豪居)。1952乍6月，平远与蕉岭合署办公，领导土地改革。8月，广东省人民政府行文: 平远并入蕉岭县 ，保留平远县名。县治没在蕉城镇。1954年3月，平远与蕉岭分县而治，平远县治迁往大柘镇。1958年11月，为适应当时人民公社、大跃迸的需要，平远并入兴宁县，县治设在兴城镇。1961年1月，兴平分县。此后，平远县治一直设在大柘镇。